丹东国投集团按照“小总部，大产业”的组织架构，精简指挥层，扩大执行层。集团总部设6个职能部门，履行风险控制、合规管理、科学决策职能，由各子公司从事具体经营业务。截至目前，集团全资、控股企业7家，参股企业2家，其中全资、控股企业有丹东国鑫资本运营有限公司、丹东国鑫投资有限公司、丹东市交通资产管理有限公司、丹东国鑫通用航空产业发展有限公司、丹东粮农产业有限公司、丹东静态停车有限公司、丹东城市开发建设投资有限公司；参股企业有辽水集团水利电力开发（丹东）有限公司、丹东临港集团有限公司。