市政府办公室设内设机构11个（不含市委外事工作委员会办公室秘书股），分别是：秘书股、会务股、综合股、法规股、调研股、市政府督查室、政务信息股、市政府总值班室、金融发展股、金融监管股及人事股，主要负责贯彻执行党的路线、方针、政策以及省委、省政府和肇庆市委、市政府的决策和决定,贯彻落实市委、市政府的工作部署；检查和督促落实市政府各项决议、决定、重要工作部署和市政府领导同志重要批示,向市政府领导报告工作的落实情况；处理各级政府、各部门报送市政府和市政府办公室的文电,审核、草拟和制发以市政府和市政府办公室名义发布的文件,报送信息资料；组织或参与全市经济社会发展重大问题调查研究，负责市政府工作情况汇报材料、重要会议的会议材料和市政府重大活动的组织安排等工作。