珲春市民族宗教事务局设5个内设机构：
　　（一） 综合科
　　组织协调局内日常行政工作，负责局会议和重要活动的组织安排，负责机关文秘、机要、保密、接待、信访、行政管理、行政执法、行政监督和老干部等工作。负责民族成份的审批、更改。
　　（二） 民族科
　　贯彻执行党的民族区域自治制度及各项民族政策法规，搞好民族团结进步活动，促进各民族的共同发展进步；参与发展少数民族教育、卫生、文化、科技、体育等项事业；调查研究少数民族和本地区经济发展中出现的新情况、新问题；负责民族贸易和民族用品生产的协调及专项资金的管理工作；贯彻执行党的民族经济政策，扶持、发展、繁荣民族经济。
　　（三）宗教科
　　贯彻落实宗教信仰自由政策，依法管理宗教事务；协同有关部门宣传党的宗教政策、法规，对宗教界人士进行爱国守法、拥护党的领导、拥护社会主义、拥护祖国统一和民族团结的教育，调查研究宗教方面的情况，负责对宗教活动和宗教活动场所的依法行政管理，帮助宗教团体在符合宪法和法律的范围内开展工作，审批办理需由政府行政机关处理的宗教团体各项事务；参与管理宗教方面的涉外活动，会同有关部门搞好宗教反渗透工作；培训宗教工作干部，为各部门处理及宗教问题的工作，提供咨询意见，参与决策。
　　（四）朝鲜语文工作科(翻译科)
　　宣传、贯彻执行党的国家的民族语文政策及《延边朝鲜族自治州朝鲜语文工作条例》；并监督、检查其贯彻执行情况；根据有关法律条款、政策，制定朝鲜语文工作的具体措施和实施规定；协调朝鲜语文工作各部门之间的业务关系；检查、督促朝鲜语文的学习、使用及翻译工作；负责朝鲜语文的规范和普及工作；负责翻译市党政机关的文件、会议材料；为机关、社会开展各项翻译咨询；统一管理全市涉外翻译。
　　（五）党建工作办公室
　　负责机关和直属单位的党群工作