深圳市大鹏新区投资控股有限公司成立于2012年6月，是大鹏新区首家区属国有企业，公司的注册资本为人民币30.6050亿元。目前公司总部有员工34名，下属企业拥有员工220余人，此外还有派驻各项目保安员2300余人。公司领导班子配备董事长1名、总经理1名、监事会主席1名、副总经理3名、财务总监1名，总部设有党群工作部、纪检监察审计部、综合办公室、投资发展部、财管中心、企业管理部、工会共7个部门。现拥有全资子公司8家（分别为鹏泰投资开发有限公司、鹏润城市综合开发有限公司、新区产业运营城市服务有限公司、鹏安市政工程有限公司、大鹏排水有限公司、大鹏文化旅游发展有限公司、鹏腾投资发展有限公司、葵涌镇投资管理有限公司），控股子公司3家（分别为新区保安服务有限公司、新区交通控股有限公司、飞流饮品实业有限公司），参股公司4家（分别为大鹏人才安居有限公司、大鹏人才服务有限公司、华侨城鹏城发展有限公司、深圳种业集团）。
公司主要业务包括城市建设板块、城市服务板块、文化旅游板块。其中城市建设板块包含在建项目绿岛国际壹中心项目、新大土地整备项目（乐高乐园项目）、水头土地整备项目，以及正在积极推进的白石岗城市更新项目盘活开发、大鹏第二工业区“工业上楼”项目、七娘山水厂利益统筹项目。城市服务板块包含生命科学产业园、海洋生物产业园改造运营，排水管网、小微水体管养运营，道路养护、扬尘治理等市政服务，安保，交通场站运营等项目。文化旅游板块包含新区休闲船舶纳管运营及临时靠泊点建设、新区党校运营，并正在积极参与“山海连城绿美深圳”大鹏新区相关工作。